- Bioinformática Aplicada a la Genómica Agropecuaria
- Biología Molecular del Virus de la Fiebre Aftosa
- Biotecnología Ambiental y Bioenergía
- Biotecnología de Gramíneas
- Epidemiología Molecular y Evolución Viral
- Espiroquetas y Antimicrobianos
- Estudios en Baculovirus
- Inmunidad Vegetal y Epigenética del Estrés
- Memoria Ambiental en Plantas
- Virología Molecular Vegetal
Resumen
Estudiamos aspectos fundamentales de la biología del virus de la fiebre aftosa (FMDV) y de su interacción con el hospedador (células y/o animales de experimentación), a fin de profundizar el conocimiento general y contribuir al desarrollo de nuevas vacunas y otros métodos complementarios para el control de esta enfermedad de gran importancia a nivel mundial
Línea de Investigación
- Estudio de determinantes de virulencia del FMDV de serotipo A. Mediante la utilización de técnicas de genética reversa construimos clones infecciosos (derivados de virus de campo con diverso grado de virulencia) y los caracterizamos en células en cultivo y en el modelo ratón adulto para identificar factores virales determinantes de virulencia. Además, realizamos estudios de estructura-función de regiones del RNA viral involucradas en la virulencia de FMDV y aplicamos algoritmos bioinformáticos para el estudio de la complejidad y la evolución de poblaciones de FMDV a partir de datos de secuenciación de alto rendimiento de genomas virales completos.
- Nuevas estrategias de control de FMDV. Trabajamos en el desarrollo de métodos antivirales contra FMDV basados en la inhibición de la replicación viral mediada por RNA no codificantes.
- Desarrollo de algoritmos bioinformáticos para estudios virológicos. Una parte de nuestras investigaciones está orientada al desarrollo de aplicaciones bioinformáticas de uso libre para el análisis de datos derivados de la caracterización fenotípica o genotípica de virus.
Integrantes
DIRECTORA
María Ines Gismondi
Investigadora Adjunta CONICET
Profesora Adjunta, Departamento de Ciencias Básicas, Universidad Nacional de Luján
Becarios/as
POSTDOCTORALES
Marco Cacciabue
Becario Post-Doctoral Conicet
DOCTORALES
Román González Mora
Becario Doctoral ANPCyT
gonzalezmora.roman@inta.gob.ar
Miembros Anteriores
- Xoana Pamela Ortiz, tesista de grado
- Anabella Paola Currá, tesista de doctorado
Producción y Financiamiento
Publicaciones destacadas
- Covidex: an ultrafast and accurate tool for virus subtyping. Cacciabue M., Aguilera P., Gismondi M.I.*, Taboga O.* (2022). Infection, genetics and evolution 99:105261. doi *Estos autores contribuyeron por igual.
- Antiviral efficacy of short-hairpin RNAs and artificial microRNAs targeting foot-and-mouth disease virus. Currá A., Cacciabue M., Gravisaco M.J., Asurmendi S., Taboga O., Gismondi M.I. (2021). PeerJ 9:e11227. doi.
- A beginner’s guide for FMDV quasispecies analysis: sub-consensus variant detection and haplotype reconstruction using next-generation sequencing. (2020). Cacciabue M., Currá A., Carrillo E., König G., Gismondi M.I. Brief Bioinf 21(5):1766-1775. doi
- ViralPlaque: a Fiji macro for automated assessment of viral plaque statistics. Cacciabue M., Currá A., Gismondi M.I. (2019) PeerJ 7: e7729. doi.
- Differential replication of Foot-and-mouth disease viruses in mice determine lethality. Cacciabue M., García Núñez M.S., Delgado F., Currá A., Marrero R., Molinari P., Rieder E., Carrillo E., Gismondi M.I. (2017). Virology 509:195-204. doi.
Subsidios
- PIP 11220200102454CO. “Estudio del interactoma celular de las regiones IRES y 3’ no codificante del genoma del virus de la fiebre aftosa como modulador de la virulencia”.
- PICT 2019-3477. “Control del virus de la fiebre aftosa mediante CRISPR-Cas13a”
- PICT 2017-2581. “Dinámica evolutiva y análisis estructural de poblaciones del virus de la fiebre aftosa y su relación con la replicación viral”.
Colaboraciones
Colaboraciones
- Dr. Gabriel Tolosa, Centro de Investigación, Docencia y Extensión en Tecnologías de la Información y las Comunicaciones (CIDETIC, UNLu). Desarrollo de algoritmos informáticos para el procesamiento de datos de predicción de secuencias blanco de silenciamiento génico.
- Dr. Rafael Fernández y Martín, Laboratorio de Biotecnología Animal, Facultad de Agronomía (UBA).
- Dra. Mariana Viegas. Laboratorio de Virología, Hospital de Niños Ricardo Gutiérrez (CABA). Consorcio Interinstitucional de Genómica de SARS-CoV-2. Proyecto PAIS.
- Participación en la Global Foot-and-Mouth Disease Research Alliance, Alianza Científica Mundial para el estudio de la Fiebre Aftosa.https://www.ars.usda.gov/gfra/