Avances en el Análisis de ADN en Eucalyptus dunnii: comparación de dos metodologías para Potenciar la Mejora y Selección Genética Forestal

Eucalyptus dunnii es una especie forestal que se introdujo en Argentina a fines de la década de 1970, por sus características de tolerancia a heladas y combinar buen crecimiento y rectitud de fuste con madera apta para pulpa, iniciándose su programa de mejoramiento en INTA en 1991. En la actualidad, dicho programa genera semillas comerciales mejoradas a partir de material genético superior. Esto contribuye a que el INTA sea proveedor de material certificado por el Registro Nacional de Comercio y Fiscalización de Semillas del INASE, asegurando el abastecimiento de la demanda tanto para productores locales como a nivel internacional. La disponibilidad y aplicación de herramientas de genotipado (determinar variantes a nivel del ADN) permite optimizar y acelerar los procesos de mejora forestal.

En el marco del proyecto internacional BiotechSur II (MINCYT-UE) en el que participaron investigadores e instituciones de 5 países (Argentina, Brasil, Uruguay, Paraguay y Portugal), liderado por el grupo de Genómica aplicada al mejoramiento de especies forestales y frutales (GAMEFF) del IABiMo, el 25 de marzo de 2024, se publicó el artículo científico “Comparison of ddRADseq and EUChip60K SNP genotyping systems for population genetics and genomic selection in Eucalyptus dunnii (Maiden)” en la revista Frontiers in Genetics (https://doi.org/10.3389/fgene.2024.1361418). En este trabajo se compara el desempeño de dos metodologías de genotipado de alto rendimiento de marcadores tipo SNPs (polimorfismo de nucleótido simple): el sistema comercial EUChip60K y un ensayo de ddRADseq (GBS o genotipado por secuenciación masiva) ajustado de manera procesiva y eficiente en el IABiMo. Ambas metodologías, que permitieron evaluar miles de variantes genéticas en 300 árboles, mostraron ser similares y complementarias tanto para su aplicación en la evaluación de la diversidad y estructura genética poblacional como en Selección genómica (que permite predecir características de los árboles a futuro) en E. dunnii.

La metodología de ddRADseq constituye una nueva herramienta de sumo interés para la selección y el mejoramiento forestal y más aún para especies forestales nativas que no cuentan con sistemas comerciales de genotipado, ya sea para estudios de diversidad genética como en su aplicación en programas de domesticación y mejoramiento. Esta metodología está disponible en la Unidad de Genómica del IABiMo y fue transferida con éxito a otras especies vegetales y animales a través de otros grupos de investigación dentro y fuera del INTA.

Este trabajo también fue financiado por el Programa de Sustentabilidad y Competitividad Forestal (PROMEF), Unidad para el Cambio Rural (UCAR), el Programa Nacional Forestal de INTA (PNFOR-1104064), el Proyecto de Investigación Científica y Tecnológica del Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación (PICT 2014-0795) y los Proyectos de  INTA 2019-PE-E6-I114-001 y PNBIO 1131042. También, se utilizaron recursos computacionales de BIOCAD, IABiMo-UEDD INTA-CONICET, del Programa de Sustentabilidad y Competitividad Forestal/BID 2853/Oc-Ar, y el Consorcio Argentino de Tecnología Genómica, MinCyT PPL 2011 004.